Le sequencage du genome d'une bacterie prometteur pour l'environnement et la medecine

Une equipe internationale, dirigee par trois microbiologistes de
l’Universite de Colombie Britannique (UBC), a acheve le sequencage du
genome
de la bacterie Rhodococcus sp. RHA1, qui represente le plus grand
genome de
bacterie sequence a ce jour. Il s’agit du premier genome de bacterie a
etre
sequence et annote au Canada. Les professeurs Lindsay Eltis, William
Mohn et
Julian Davies ont ete les fers de lance de cette recherche. Leur
objectif de
depart etait de mieux comprendre comment cette bacterie est capable de
degrader des polluants toxiques. Au bout du compte, cette etude leur a
aussi
permis de trouver des idees pour reduire les couts de production
d’antibiotiques.
Le sequencage du genome de cet organisme aide a comprendre son aptitude
exceptionnelle a decomposer le PCB et autres dechets toxiques et son
adaptation aux stress environnementaux. Grace a leur plasticite
genetique et
a leurs capacites catalytiques, les microorganismes tels que
Rhodococcus sp.
RHA1 peuvent degrader des composes organiques complexes. La bacterie a
ete
isolee a partir de terre contenant du lindane, un insecticide hautement
toxique, par le professeur Masao Fukuda de Nagaoka, au Japon. Elle a
ete
choisie car elle est deja utilisee dans de nombreux procedes
industriels.
Les recherches ont aussi montre que les rhodococci etaient
genetiquement
tres proches des streptomycetes, une famille de bacteries qui produit
plus
de 70% des antibiotiques utilises aujourd’hui. Les chercheurs esperent
que
leurs resultats seront repris par d’autres equipes pour developper de
nouveaux antibiotiques ou autres produits pharmaceutiques. Le
sequencage et
l’assemblage de l’ADN ont ete realises au Michael Smith Genome Sciences
Center (GSC), alors que l’analyse de la sequence et les recherches
experimentales qui ont suivi ont ete effectuees par le Microbial
Envirogenomics Group (MEG) tous deux a UBC. La sequence et l’annotation
du
genome de Rhodococcus sp. RHA1seront presentees a la communaute
scientifique
a la Conference Internationale sur les Genomes Microbiens du 13 au 16
avril
2005 a Halifax.

Contacts :

The official Rhodococcus Genome Project web site :
http://www.rhodococcus.ca/
Genome British Columbia, Linda Bartz, Director Communications :
lbartz genomebc.ca
Sources : Globe and Mail, 21/03/2005
Redacteur : Delphine DUPRE, VANCOUVER
attache-scientifique consulfrance-vancouver.org