La plate-forme de genomique de l'Universite de medecine d'Innsbruck produit ses premiers resultats

L’Universite de medecine d’Innsbruck avait decide de construire une plate-forme de genomique, afin de mutualiser ses ressources, mais aussi pour inciter ses chercheurs a s’associer. Cette plate-forme, denommee Gene Discovery Core Facility, est desormais totalement operationnelle et lance de ce fait un appel a collaborations : les chercheurs et institutions de tous pays sont invites a user de cette plate-forme et a tirer profit de ses caracteristiques.
La plate-forme Gene Discovery Core Facility a effectivement la particularite d’etre polyvalente : elle comprend trois unites, l’une consacree a l’etablissement de profils d’expression, la seconde a la bioinformatique, et la troisieme au genotypage et au sequencage. Ses trois unites, geographiquement proches l’une de l’autre, peuvent collaborer avec profit.
L’unite de profilage genetique, dirigee par Reinhard Kofler est implantee a l’Institut tyrolien de recherche sur le cancer (TFKI, http://www.tkfi.at).
Elle a recours aux technologies Affymetrix ; 150 profils d’expression y ont deja ete etablis, entre autres pour etudier les effets du glucocorticoide sur des enfants atteints de leucemie.
L’unite de bioinformatique (FGBU, Functional Gene Expression Bioinformatics Unit), dirigee par Florian Uberall est implantee dans le Biocentre d’Innsbruck (Biozentrum Innsbruck, http://www.i-med.ac.at/biocenter/). Elle permet l’analyse des resultats des biopuces, par des methodes bioinformatiques, biostatistiques ou issues des sciences de l’information.
Elle a egalement participe a une etude sur la leucemie, l’etude CELSG (Central European Leukemia Study Group), conduite par Gunther Gastl de la Division d’hematologie et d’oncologie. Des collaborations se mettent egalement en place avec Novartis, Melasan et Padma AG, ainsi qu’avec l’Universite Leopold Franzen d’Innsbruck. Son Institut de chimie analytique et de radiochimie travaillera avec l’unite de bioinformatique a l’identification de biomarqueurs robustes sur la base de donnees spectroscopiques.
L’unite de genotypage, dirigee par Florian Kronenberg, est quant a elle impliquee dans l’etude Framingham (identification des facteurs de risques associes a l’atherosclerose et aux maladies cardiovasculaires) et dans le projet GOLD (Genomics of Lipid-associated Disorders, cluster de recherche autrichien dedie a l’etude du metabolisme des lipides, http://gold.uni-graz.at).

Contacts :
Florian Uberall, Gene Discovery Core Facility, Medizinische Universitat Innsbruck, Fritz Preglstra