L'expertise americaine en genomique issue du projet de sequencage du genome humain, au service de la caracterisation genetique des cancers a grande echelle

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Forte de son expertise en analyse genomique a haut debit, l’Ecole de
medecine de l’Universite de Stanford a ete designee, avec 7 autres ecoles de
medecine des Etats-Unis, comme Cancer Genome Characterization Center.
Ce programme fait partie du projet pilote national « Cancer Genome Atlas »
mene par le National Cancer Institute et le National Human Genome Research
Institute.
Les collaborateurs de ce projet ont pour objectif d’utiliser les capacites
d’analyse genomique a grande echelle de leurs laboratoires pour determiner,
a l’echelle du genome entier, les variations genetiques associees aux
cancers.
Trois types de cancers seront notamment etudies, les cancers du poumon, du
cerveau et des ovaires. Les chercheurs pensent ainsi pouvoir localiser de
nouvelles cibles therapeutiques pour le developpement de nouveaux
traitements anticancereux. Le budget annuel global du projet atteint 11.7
millions de dollars.
Richard Myers, directeur du Stanford Human Genome Center prend la tete du
projet sur Stanford. Les capacites de genotypage a haut debit de son groupe
seront utilisees pour localiser les anormalites chromosomiques dans des
echantillons de tumeurs, comme par exemple l’addition ou la deletion de
larges fragments de chromosomes.
Le travail pourrait permettre de classifier les cancers selon leur
anormalite genetique dans l’espoir de developper des traitements et
protocoles plus specifiques pour chaque type de patient.
Six autres centres Cancer Genome Characterization Center sont associes au
projet :

Lawrence Berkeley National Laboratory
Memorial Sloan-Kettering Cancer Center
Sidney Kimmel Comprehensive Cancer Center at Johns Hopkins University
University of North Carolina Lineberger Comprehensive Cancer Center
Broad Institute of MIT and Harvard
Harvard Medical School and Brigham and Women’s Hospital
Le centre de Berkeley se specialisera dans l’identification des variations
de populations d’ARN messagers dans les cellules cancereuses. Il utilisera
la plate-forme technologique Affymetric Exon 1.0 pour la mesure specifique
de l’expression des exons dans plus de 1000 echantillons par an.

Pour en savoir plus, contacts :
http://grants.nih.gov/grants/guide/rfa-files/RFA-CA-07-014.html
Sources : - Stanford Report, 01/11/2006
http://redirectix.bulletins-electroniques.com/5X2b8