Evolution du virus de la grippe saisonniere

Des chercheurs de la « National Library of Medecine » du "National Center for
Biotechnology Information« (NCBI) et du »Fogarty International Center" ont
publie, dans le journal Biology Direct, une etude permettant de mieux
comprendre l’evolution des virus grippaux.
Les chercheurs ont analyse une large collection representative des deux
souches les plus connues de la grippe, a savoir H1N1 et H3N2. Ces virus ont
ete collectes entre les annees 1995 et 2005 dans l’etat de New York et en
Nouvelle Zelande. Les banques de donnees provenaient de l’"Influenza Genome
Sequencing Project« et ont ete financees par le »National Institute of
Allergy and Infectious Desease" qui a recemment mis a disposition plus de
1000 genomes complets de virus grippaux provenant de patients.
Jusqu’a maintenant, l’evolution de ce virus etait percue comme un procede
darwinien classique. En effet, il etait plus ou moins admis que la
principale proteine de surface nommee Hemaglutinine changeait
continuellement afin de se soustraire au systeme immunitaire de l’hote. Cela
creait un avantage selectif qui permettait de maniere continue d’eliminer
les virus « competiteurs ».
Alors que ce mecanisme semble etre effectivement applique par le virus H1N1,
la periode de selection semble etre une suite de sequences interrompues dans
le cas du virus H3N2. En effet, ce virus semble etre la plupart du temps en
periode de latence et ne presente pas d’exces significatif de mutations dans
sa region antigenique. Les chercheurs ont note que, pendant ces periodes de
latence, aucune des souches circulantes ne prend le dessus sur les autres.
Il semble d’ailleurs que de multiples variations soient necessaires pour
permettre au virus d’echapper au systeme immunitaire. En consequence, de
nombreuses varietes de souches s’accumulent. Lorsque la mutation apportant
un avantage selectif apparait, la periode de latence laisse place a un
episode darwinien ou le nouveau virus dominant s’etend rapidement a la
population humaine et elimine les autres variants de son espece.

L’equipe dirigee par David Lipman conclut que la vision habituelle de
l’evolution du virus de la grippe, a savoir rapide et controlee par un
procede de selection positive, apparait a leurs yeux incomplete. Les
periodes de latence interrompues par de courtes periodes de selection
suggerent que le sequencage d’un plus grand nombre de virus sur des patients
permettrait d’ameliorer la qualite des methodes de prevention. En parallele,
la substitution d’aminoacides pourrait egalement etre un bon moyen pour
prevoir les futures souches dominantes et de gagner un temps precieux pour
l’elaboration de vaccins.

Pour en savoir plus, contacts :
http://en.wikipedia.org/wiki/Influenza
Sources : - http://www.nih.gov/news/pr/oct2006/nlm-25.htm