Etude de l'apport de l'ordinateur pour les scientifiques

Les chercheurs de l’institut de recherche en technologies de l’information EML Research de Heidelberg ont publie dans leur premier rapport annuel les conclusions de leurs recherches concernant l’apport de l’ordinateur et des logiciels de simulation dans le travail des scientifiques.
Le rapport fait notamment le point sur la solution logicielle COPASI developpee par un groupe de recherche en bioinformatique de l’EML en cooperation avec le « Virginia Bioinformatics Institute » aux Etats-Unis.
COPASI permet d’analyser et de simuler des processus biochimiques et convient particulierement aux chercheurs en laboratoires qui souhaitent examiner une hypothese ou mettre au point des experiences.
COPASI est un element important du paquet d’outils et de methodes de calcul « SYCAMORE » utilise par de nombreux chercheurs. La particularite de ce paquet est qu’il ne met pas seulement a disposition des chercheurs differentes methodes de calcul, mais egalement qu’il peut les aider a choisir la bonne methode pour leurs experimentations a l’aide d’une simulation. L’ordinateur n’a pas pour vocation de remplacer le tube a essais mais plutot de completer judicieusement l’experimentation. Un exemple : un scientifique cherche un inhibiteur pour une proteine qui declenche certains processus de metabolisme. « SYCAMORE » lui permet de voir s’il est possible de determiner cet inhibiteur au moyen de calculs, et egalement quel processus biochimique est alors le plus inhibe. Deux groupes de travail de l’EML Research travaillent sur ce projet qui est soutenu par le BMBF.
L’EML Research coopere tres etroitement avec des partenaires nationaux et internationaux. Un exemple a cela est la creation a Heidelberg du premier centre allemand de modelisation et de simulation pour les sciences de la vie
(BIOMS) dont l’EML est un des partenaires aux cotes du centre allemand de recherche sur le cancer, l’EMBL (European Molecular Biology Laboratory), l’institut Max Planck de recherche medicale ainsi que l’universite de Heidelberg.
Le rapport annuel de l’EML (CD et brochure en anglais) peut etre commande en contactant directement le centre (voir Contacts) ou etre telecharge au format pdf a l’adresse suivante :
http://www.eml-research.de/downloads/eml/EMLR_AR_03-04.pdf

Contacts :

D^r. Peter Saueressig, EML Research gGmbH, tel : +49 6221 533 245, fax : +49
6221 533 198, email : peter.saueressig eml-research.de Sources : Depeche idw, Communique de presse de l’EML Research, 27/07/2005 Redacteur : Nicolas Condette, nicolas.condette diplomatie.gouv.fr