Des chercheurs de la societe Fraunhofer utilisent des « Grid-Computing » pour combattre la malaria

Pour la premiere fois, des chercheurs de l’institut Fraunhofer pour le calcul algorithmique et scientifique (SCAI) ont montre que le Grid Computing accelere radicalement le developpement de nouveaux principes actifs dans la lutte contre les maladies. En seulement 40 jours, 1.000 ordinateurs dans 15 pays ont calcule simultanement 46 millions de combinaisons de principes actifs.
Dans le projet EGEE (Enabling Grids for E-SciencE Science La science est désormais l’affaire de tous. Découvrez la science d’une manière ludique et active. Nous vous proposons d’en découvrir plus sur nos expéditions à la voile, découverte du plancton. ), soutenu par la Commission Europeenne a hauteur de 32 millions d’euros, l’infrastructure pour le calcul scientifique de demain se construit. Le SCAI est l’un des noeuds de ces groupes d’ordinateurs, comme le CERN a Geneve. Les ordinateurs du EGEE-Grids, concus pour traiter la gigantesque masse d’informations provenant des experiences de la physique des particules, peuvent egalement servir pour le calcul en bio-informatique et bio-medecine, comme l’a montre l’exemple de la malaria.
Avec leurs collegues du laboratoire de physique corpusculaire de Clermont-Ferrand (IN2P3), les chercheurs du SCAI developpent un ecran virtuel pour le recherche de principes actifs qui est executable sur l’infrastructure du EGEE-Grids.
Developpe par le SCAI et utilise pour la recherche d’agents actifs contre la malaria, le programme FlexX examine les proprietes de liaison des molecules et determine les combinaisons prometteuses. Dans le cas de la malaria, le logiciel devait s’interesser aux capacites d’un millions de ligands a interagir avec 5 molecules cibles. Les resultats du calcul ont ensuite ete soumis a des chercheurs, qui ont retenu les combinaisons les plus interessantes et les ont ensuite transmises aux laboratoires pharmaceutiques pour y etre testees « en vrai ». A terme, un nouveau medicament contre la malaria pourrait voir le jour.
L’utilisation du « Grid-Comuting » pourrait a l’avenir accelerer considerablement le developpement de nouveaux medicaments tout en abaissant les coups de la recherche.

Contacts :

D^r. Martin Hofmann, Directeur bio-informatique - Institut Fraunhofer pour le calcul algorithmique et scientifique (SCAI) - tel : +49 2241 14 2802 - email : Martin.hofmann scai.fraunhofer.de Sources : Depeche IDW, 25/08/2005 Redacteur : Nils Derboule, nils.derboule diplomatie.gouv.fr